Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Serpina1cQ00896 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms