Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VegfaQ00731 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms