Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms