Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Flt3Q00342 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Flt3Q00342 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms