Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms