Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cry1P97784 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms