Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RptnP97347 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RptnP97347 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RptnP97347 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RptnP97347 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RptnP97347 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms