Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx1P83917 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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