Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb2P81069 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms