Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx2P81066 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx2P81066 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx2P81066 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx2P81066 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms