Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx2P80206 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx2P80206 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx2P80206 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms