Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Otx1P80205 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Otx1P80205 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Otx1P80205 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Otx1P80205 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Otx1P80205 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx1P80205 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Otx1P80205 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx1P80205 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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