Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1bP70700 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms