Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx3P70354 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Msx3P70354 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx3P70354 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms