Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgif1P70284 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms