Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chl1P70232 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chl1P70232 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms