Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps18P62270 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps18P62270 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms