Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnnP61807 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnnP61807 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnnP61807 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnnP61807 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnnP61807 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnnP61807 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms