Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ActbP60710 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ActbP60710 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ActbP60710 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms