Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nphp4P59240 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp4P59240 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp4P59240 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms