Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms