Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Strn4P58404 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn4P58404 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn4P58404 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Strn4P58404 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms