Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opa1P58281 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opa1P58281 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms