Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tm9sf2P58021 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf2P58021 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms