Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtnsP57757 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtnsP57757 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms