Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samsn1P57725 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Samsn1P57725 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms