Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn18P56857 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn18P56857 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn18P56857 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn18P56857 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms