Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301 ms