Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc4rP56450 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc4rP56450 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms