Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CdaP56389 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CdaP56389 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CdaP56389 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms