Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms