Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GemP55041 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GemP55041 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GemP55041 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GemP55041 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GemP55041 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GemP55041 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GemP55041 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GemP55041 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GemP55041 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms