Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrlP54846 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NrlP54846 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrlP54846 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrlP54846 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrlP54846 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrlP54846 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms