Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms