Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms