Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e3P52483 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms