Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr4P51680 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms