Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms