Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RoraP51448 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RoraP51448 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RoraP51448 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RoraP51448 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RoraP51448 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RoraP51448 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RoraP51448 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms