Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms