Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pa2g4P50580 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pa2g4P50580 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms