Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb1P50571 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms