Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SftpdP50404 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms