Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms