Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms