Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psen1P49769 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psen1P49769 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psen1P49769 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms