Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms