Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prox1P48437 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prox1P48437 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms