Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms