Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VdrP48281 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VdrP48281 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VdrP48281 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VdrP48281 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms